Καρκίνος: Αυτά τα 4 γονίδια βοηθούν στην πρόβλεψη του αποτελέσματος
Η εκτεταμένη έρευνα για τον ρόλο του καταστολέα όγκου p53 προσφέρει μια καλύτερη κατανόηση των γενετικών μεταλλάξεων που παίζουν σε διάφορες μορφές καρκίνου, καθώς και τον εντοπισμό τεσσάρων γονιδίων που μπορούν να βοηθήσουν στην πρόβλεψη της προοπτικής ενός ατόμου.
ο ΤΡ53 Το γονίδιο είναι υπεύθυνο για την κωδικοποίηση αυτού που οι επιστήμονες αποκαλούν πρωτεΐνη όγκου p53 - ένα κατασταλτικό όγκο που μπορεί να σταματήσει τα κύτταρα να διαιρούνται και να πολλαπλασιάζονται πολύ γρήγορα.
Οι ερευνητές έχουν μεταγλωττιστεί ΤΡ53 ο «φύλακας του γονιδιώματος» λόγω του κρίσιμου ρόλου του στην πρόληψη των όγκων και στην παρακολούθηση της κυτταρικής διαίρεσης.
Οι καρκίνοι στον άνθρωπο συχνά εμφανίζουν μεταλλάξεις στο ΤΡ53 γονίδιο, προκαλώντας αποτυχία ενός από τους κρίσιμους αμυντικούς μηχανισμούς κατά του καρκίνου.
Οι πρώτες μελέτες που εντόπισαν ΤΡ53 μεταλλάξεις στους καρκίνους του ανθρώπου εμφανίστηκαν τη δεκαετία του 1980 και, από τότε, οι ερευνητές έχουν αφιερώσει πολύ χρόνο και πόρους για να διευκρινίσουν τον ρόλο του στον καρκίνο.
Τώρα, η μεγαλύτερη μελέτη του είδους της χρησιμοποιεί δείγματα όγκων από περισσότερους από 10.000 ασθενείς με καρκίνο και εξετάζει 32 διαφορετικούς τύπους καρκίνου για να κατανοήσει καλύτερα τον ρόλο του ΤΡ53.
Ο Δρ Larry Donehower, καθηγητής μοριακής ιολογίας και μικροβιολογίας στο Baylor College of Medicine στο Χιούστον, TX, ηγήθηκε της νέας έρευνας, η οποία εμφανίζεται στο περιοδικό Αναφορές κυττάρων.
Τα γονίδια Telltale 4 μπορούν να βοηθήσουν στην πρόβλεψη της προοπτικής
Ο Δρ Donehower και η ομάδα χρησιμοποίησαν πέντε διαφορετικές πλατφόρμες δεδομένων για να εξαγάγουν 10.225 δείγματα από 32 καρκίνους. Χρησιμοποιώντας το Cancer Genome Atlas (TCGA), οι ερευνητές μπόρεσαν να εκτιμήσουν διεξοδικά τον ρόλο της οδού p53 σε αυτούς τους 32 καρκίνους.
Ο Δρ Donehower και οι συνάδελφοί του συνέκριναν στη συνέχεια τα δεδομένα TCGA με μια άλλη βάση δεδομένων 80.000 γενετικών μεταλλάξεων που είχε συγκεντρώσει ο Δρ Thierry Soussi - καθηγητής μοριακής βιολογίας στο Πανεπιστήμιο Sorbonne στο Παρίσι της Γαλλίας για μια περίοδο 30 ετών.
Οι ερευνητές το βρήκαν ΤΡ53 Οι μεταλλάξεις εμφανίστηκαν συχνότερα σε άτομα που είχαν φτωχότερες προοπτικές. Επιπλέον, η ανάλυση διαπίστωσε ότι «Περισσότερο από το 91% των καρκίνων με ΤΡ53 μεταλλάξεις δείχνουν απώλεια και των δύο λειτουργικών ΤΡ53 αλληλόμορφα »ή παραλλαγές γονιδίων.
Ο Δρ Donehower εξηγεί: «Σε ορισμένα γονίδια καρκίνου, θα δείτε ένα αντίγραφο των δύο γονιδίων να χάνεται ή να μεταλλάσσεται», αλλά «πάνω από το 91% όλων των καρκίνων χάνουν και τα δύο ΤΡ53 γονίδια, όχι μόνο ένα. "
Η δεύτερη απώλεια αλληλόμορφων, γράφουν οι συγγραφείς, συνέβη με «μετάλλαξη, χρωμοσωμική διαγραφή ή απώλεια ετεροζυγωτικότητας ουδέτερης αντιγραφής» - δηλαδή, αναπαραγωγή γονιδίων. Ο επικεφαλής ερευνητής σημειώνει επίσης ότι αυτή η τελευταία διαδικασία συνέβη πολύ πιο συχνά από ό, τι πίστευαν προηγουμένως.
Σημαντικά, η έρευνα εντόπισε επίσης τέσσερα γονίδια που έδειχναν υπερέκφραση σε μεταλλαγμένο ΤΡ53 όγκοι. Σύμφωνα με τους ερευνητές, αυτά τα τέσσερα γονίδια μπορούν να «πει» εάν ένας ασθενής με καρκίνο έχει καλή προοπτική ή όχι.
«Εάν έχετε υψηλή έκφραση αυτών των τεσσάρων γονιδίων, έχετε έναν ασθενή που είναι πιο πιθανό να έχει κακή πρόγνωση […] Αντίθετα, εάν αυτός ο ασθενής έχει πολύ χαμηλή έκφραση αυτών των γονιδίων, πιθανότατα θα επιβιώσει περισσότερο και θα έχει καλή πρόγνωση. "
Δρ Larry Donehower
«Θα σου δώσει μια καλύτερη εικόνα για το πώς θα τα πηγαίνει από το να ξέρεις αν είναι μεταλλαγμένος ΤΡ53 ή όχι », συνεχίζει ο Δρ Donehower.
Τέλος, η μελέτη συνδέθηκε στενά ΤΡ53 μεταλλάξεις με γονιδιωματική αστάθεια, ένα εύρημα που συνάδει με ΤΡ53Ο τυπικός ρόλος ως «φύλακας του γονιδιώματος».
Ο Δρ Donehower σχολιάζει τη μοναδικότητα της νέας έρευνας, λέγοντας: «Οι περισσότερες μελέτες για ΤΡ53 επικεντρωθείτε σε έναν τύπο καρκίνου. "
«Κοιτάζοντας 32 διαφορετικούς τύπους καρκίνου, βλέπετε ότι ορισμένα μοτίβα παραμένουν ανεξάρτητα από τον τύπο του καρκίνου».
Ο συν-συγγραφέας της μελέτης και διευθυντής του Cancer Genomics στο Baylor College of Medicine, Δρ David Wheeler, σχολιάζει επίσης τη σημασία των ευρημάτων.
Λέει: «Από τότε ΤΡ53 είναι ένας από τους πιο σημαντικούς φύλακες στην πρόληψη του καρκίνου, όσο καλύτερα κατανοούμε αυτό το γονίδιο, τόσο καλύτερα θα μπορούμε να κατανοήσουμε τη βασική βιολογία του καρκίνου. Αυτό θα οδηγήσει σε καλύτερες θεραπείες. "
